Ένα από τα βασικά προβλήματα που αντιμετωπίζουν τα Πληροφοριακά Συστήματα (ΠΣ) του Δημόσιου Τομέα είναι αυτό της διαλειτουργικότητας. Παρά το γεγονός ότι έχει αναπτυχθεί το Πλαίσιο Διαλειτουργικότητας (ΠΔ) – (http://www.e-gif.gov.gr/portal/page/portal/egif/) αυτό δεν λαμβάνεται υπόψιν στα υπο-σχεδιασμό και υπό – ανάπτυξη ΠΣ του Δημοσίου Τομέα τα οποία και «αδιαφορούν» ως προς την διαλειτουργικότητα μέχρι την στιγμή που θα αντιμετωπίσουν το πρόβλημα.
Σημαντικό πρόβλημα στο θέμα της διαλειτουργικότητας αποτελεί και το γεγονός ότι ο πολίτης δεν αναγνωρίζεται μοναδικά ως φυσικό πρόσωπο με ένα και μόνο αναγνωριστικό. Ανάλογα με τον Φορέα που «τρέχει» το ΠΣ μπορεί να χρησιμοποιείται ως αναγνωριστικό ο Αριθμός Φορολογικού Μητρώου, ο Αριθμός Δελτίου Ταυτότητας, ο Αριθμός Κοινωνικής Ασφάλισης κλπ Προφανώς οι αριθμοί αυτοί μπορεί να μην είναι μοναδικοί (βλέπε ταυτότητα), δίνονται στον πολίτη σε διαφορετικές ηλικίες και δεν τον αναγνωρίζουν μοναδικά σε όλη την φάση της ζωής του. Προτείνεται η υλοποίηση μίας διαδικασίας που θα δίνει μία και μοναδική ταυτότητα σε κάθε πολίτη από την στιγμή της γέννησης του.